Федеральная служба безопасности и Министерство обороны России наделены полномочиями утверждать решения о выдаче иностранным судам разрешений на работу во внутренних водах РФ, в исключительной экономической зоне и на континентальном шельфе. Это предусмотрено новыми правилами, утвержденными правительством.

Кабмин разрешил привлекать суда под иностранным флагом для каботажных грузоперевозок, поисковых и гидротехнических работ, а также для разведки морских ресурсов — при условии получения соответствующего разрешения. Согласно документу, выдачу таких разрешений осуществляет Федеральное агентство морского и речного транспорта (Росморречфлот), но исключительно по согласованию с ФСБ и Министерством обороны и на основании заявления.